1:12:26 AM PDT - Thu, May 25th 2017 |
|
Hello,
I previously used the following input file to constrain the Cartesian coordinates of some atoms, worked without any problems:
start geom_1
title "DP-Mes geometry relaxation"
echo
memory total 4000 mb
constraints one
fix atom 9 13:14
fix atom 42 45:46
end
set constraints one
geometry noautoz
C -4.465439777516245989374965574825 2.840834064089797994512309742277 -4.277596737586850217383016570238
C -4.469463027071183702787493530195 1.405690204089798056585891572468 -4.303767315603653109690185374347
C -3.603117535504297919146665662993 0.724333783166223099669878138229 -3.518816749275908595251394217485
C -2.672756841327013077602714474779 1.426297923325316574505450262222 -2.647388105542451963714256635285
C -2.668645800244344723495260041091 2.878512189658765763056180730928 -2.621637843331020789605645404663
C -3.594627189061317729112943197833 3.550257074693953018851289016311 -3.467307704241954446899853792274
C -1.779917277508305639699415223731 3.570390475068639712930007590330 -1.778837319238987246805550057616
C -0.881427623433614804149272003997 2.908712662311789376445858579245 -0.924401862586118117093292312347
C -0.885964253905191512217243143823 1.448953270867075149297420466610 -0.950215377769993096990219783038
C -1.788827354867923435932652864722 0.761239242401741900145850650006 -1.828262547607430787977023101121
C -0.009548915881450740356095607808 3.631686369388908097732837632066 -0.050030221559949412946100011368
C 0.844491307483022923818793969986 2.933436936771573133597712512710 0.815888416497244084446549550194
C 0.841288988539175885961185485939 1.472414397910741135078183106089 0.791119779785639520852669193118
C -0.016587966741588730523737638123 0.750734229388908103075550570793 -0.098373622595290935444189983627
C 1.705479053408331946428688752349 3.622782634625814068840554682538 1.735475879844375013405510799203
C 2.528041196172119420282342616701 2.958328779730142521486868645297 2.617091939946968981445252211415
C 2.524421168144910243569256635965 1.505578816063591451879233318323 2.591177424374532911599544604542
C 1.698516051854086938988075417001 0.812475186376074520744339224620 1.686918605670558735099007208191
C 3.381215479799513978775848954683 3.660320895306047095374424316105 3.564820586286121528729609053698
C 4.170527898066596961257346265484 2.979299026521294191383049110300 4.427052836219217191171537706396
C 4.167152232789300470017224142794 1.544152986521293735577842198836 4.400745874230316267983198486036
C 3.373985691300728007036013877951 0.834618297139322784516934916610 3.513046743919065573180660067010
H -5.166380402530621473999872250715 3.363855109317531066892570379423 -4.912779532937987525542666844558
H -3.589261187978649569885192249785 4.643229815305044638762410613708 -3.445175874139360328030079472228
H -5.173379427362856830541204544716 0.860520570234169168699622787244 -4.958574502196554156796537426999
H -3.605150662086793023064501539920 -0.368462076222685064319506409447 -3.537260659072956503479190359940
H -1.778679640925810545581953192595 4.661473963235364337265309586655 -1.762686957469148829602545447415
H -1.795953001284387617886295629432 -0.329330724848344857935700247253 -1.851507562349713253979643923230
H 1.711722356324276050898447465443 4.714102306153543864297716936562 1.757355514975218691020586447848
H 1.701172626659806175197786615172 -0.278524466373838819333030869529 1.673108319095000906528980522125
H 3.382378767521177387322950380621 4.753234005000501305460147705162 3.583368360055266599317747022724
H 4.811769675496588405394504661672 3.524770381904652527538246431504 5.144639538423709801406857877737
H 3.368688807468146251267171464860 -0.258282723777314981994379650132 3.490789310761012842476702644490
H 4.805735707997454753126476134639 1.021283920682468648877261330199 5.098568201832042845467185543384
C 4.538471400029754576621598971542 -1.531558944671908450985142735590 -4.202283280244575536244155955501
C 4.545439200275331437239856313681 -2.966681254366362097130149777513 -4.175961318312173986555535520893
C 3.653456917187652308598444506060 -3.650471639232049980705596681219 -3.391992129181484738609242413077
C 2.695372952187151227576578094158 -2.951418474625814081235830599326 -2.572999500900527536373374459799
C 2.688769087135854274350776904612 -1.498804092792538789069567428669 -2.598711944888734581837752557476
C 3.640398070140517639003974181833 -0.824761470759779791173116336722 -3.443516797157898601255965331802
C 1.777454114991328548711635448853 -0.808330108574864203418997021799 -1.801879353668786709619098473922
C 0.861816010086484007857166034228 -1.470752044968281602166371158091 -0.941599595521640631012871835992
C 0.867344687804678771136934756214 -2.931510970162562124130545271328 -0.916276913755270649986073294713
C 1.788585280650248687805969893816 -3.618332862852507325612805288984 -1.753060780607623270199724174745
C -0.022617132573476816242985520944 -0.750801880611091876360774222121 -0.100048721761668568674963353260
C -0.878679835024781308305819038651 -1.450743056253902096841557067819 0.786525389672639962945766001212
C -0.872310031889775294722255694069 -2.910676690142983691345079932944 0.810297086550275325045333829621
C -0.010903205692372942847701011715 -3.631709429999999905191998550436 -0.053021382450071576075689705476
C -1.736089209731375593293023484875 -0.765431361730681714128365911165 1.687086451302963530096690192295
C -2.547775292698115201517339301063 -1.432941495985277313707229041029 2.600555445277296318096205141046
C -2.541900288646471217646194418194 -2.885218813235363999325500117266 2.625215738265850085042529826751
C -1.725011971794118581513544086192 -3.574702455925309330098116333829 1.733102826948009322904908913188
C -3.388561963499517659670345892664 -0.733863616490306958084488542227 3.536480138896520131197576120030
C -4.162795678721546543954445951385 -1.417778770744902772094064857811 4.437631381004124797584609041223
C -4.156604690697806248067536216695 -2.852897870439357053129469932173 4.462674250103596307326370151713
C -3.376958199979418928649010922527 -3.559724927101398872508752901922 3.585660643345898179745745437685
H 5.259676369816395968825872841990 -1.006570458946082657902820756135 -4.835915792427255333052471542032
H 3.634026264504644831987434372422 0.268074899240220265728140702777 -3.461775678648706833229198309709
H 5.271948035169771173968911170959 -3.509965668946082750778714398621 -4.789803843281688955357822123915
H 3.656585999851082124934009698336 -4.743333988315412419467520521721 -3.369854724635217291250910420786
H 1.777102251105715513546101647080 0.282557202952865349487865387346 -1.825069943160288810091174127592
H 1.795372679564111617622756966739 -4.709638084074691199987228173995 -1.737212928671753919829257029050
H -1.745761188117161744060013006674 0.325223936436042804221102642259 1.673787557005742110405321909639
H -1.724584162657724961675853592169 -4.665797894397579526071240252350 1.753432069106409141312497013132
H -3.390659660274558895309837680543 0.358924692898601238599809448715 3.515481526877635154448853427311
H -4.793438595796429169126895430963 -0.874604175248544724041721565300 5.147271681654372876835168426624
H -3.370691186176820952624666460906 -4.652657227101398618174243893009 3.603129848420242087314591117320
H -4.782716302136815755829957197420 -3.377889473720815161073005583603 5.191176928800633305627343361266
C 0.002910628336223801577997694068 5.133428579083362031099113664823 -0.026321398986472593906071892889
C -0.851742440641075959639749726193 5.837988357280070594867993349908 0.853383192839865856171854829881
C -0.807361735679731684633964050590 7.238201198502254740674288768787 0.873384794519751928021378262201
C 0.058000371619917757970430471914 7.965494069694454282171136583202 0.045614181400855782766434742825
C 0.892918453460130434606867311231 7.249329892414383635923513793387 -0.818518326034840093541333772009
C 0.881338127276602323334486754902 5.847121772108836879056070756633 -0.871176099242455870275136931014
H -1.468092200850965367564526786737 7.776085543809534428305596520659 1.560401374874860414010413478536
H 1.579751944150769027430669666501 7.795343400773653286250919336453 -1.472408409512313554046158969868
C -0.015687434636220024680719475896 -5.133474889999999568601651844801 -0.034573023486646023427759644164
C -0.885509737299649435371406980266 -5.831008867864647449152926128590 -0.887085079159440459406482659688
C 0.843285061448182826637776088319 -5.854087142135353083460813650163 0.841858202398273247624160831037
C 0.811860079731375416933758515370 -7.253418069690985348074718785938 0.849734704692719833296621345653
C -0.045880967458742996645248979348 -7.965410870000000365109826816479 0.014056004768798046472566554144
C -0.884204298405364852442289702594 -7.233972800003468428542419133009 -0.846402456864994046092931512248
H 1.477916689399313865393992273312 -7.803630616771572547918367490638 1.531712285300343090455044148257
H -1.562203282513508595386042543396 -7.767777292922880327807888534153 -1.508619032786834512904761140817
C -0.055628884618877189049968023937 -9.475746410916636719434791302774 0.047712309006051063786646437848
H -0.808311196860292513477475040418 -9.877265472225305487086188804824 -0.640478302615099637229434392793
H 0.954032966762400125304566245177 -9.895992946768105369415025052149 -0.211447062777661787258409731294
H -0.306057670198250586501842462894 -9.859983197117509590157169441227 1.033404047123212876613251864910
C -1.813768296273480462588167938520 -5.090032806257370090463609813014 -1.835919315515936567351218400290
H -2.414506983105022097646497059031 -5.791715168343160691222237801412 -2.419461977326164969781530089676
H -2.506416599524954769151463551680 -4.423083622624272237544573727064 -1.295186640872779459954244885012
H -1.253927494025128153154469146102 -4.455657624918718084927604650147 -2.543729766595136609907967795152
C 1.786429307944193967117030297231 -5.133808183742630149026808794588 1.764203620266389105353255217778
H 2.371762139973484284638516328414 -5.848527939823563670529438240919 2.374214459900874540920767685748
H 2.497337544274174536695909409900 -4.504962641985431837099440599559 1.203789074075923615225747198565
H 1.236191023776082031915279912937 -4.463952152915944715516616270179 2.443000788078004692494005212211
C 0.069470405106563798414143207083 9.474752578083709408929280471057 0.075605348716615061732682079310
H 0.988214996457856931222352159239 9.901196169661000467954181658570 -0.392903440958260574689120403491
H -0.816572371362931703764331814455 9.822992704710062028539141465444 -0.451620749124985010336530422137
H 0.025127220825452316332881963490 9.904518982463946130678777990397 1.092000769052144937276693781314
C 1.807210378671753936430377507349 5.122949932772960401905493199592 -1.821588969873126240273109033296
H 2.416402377223570763220550361439 5.835417975021313097272468439769 -2.397312141128762341679703240516
H 2.487012427566038130777315018349 4.492578882373993387489008455304 -1.278126443034647730101482920873
H 1.249471260202952072049242815410 4.454063532949396275739673001226 -2.541430105671561801017332982155
C -1.801834235330327160795604868326 5.101078398449223172406163939741 1.769604385819246727962195109285
H -2.386860099445407890073056478286 5.805388318950783776983826101059 2.379138310980074333400580144371
H -2.510537328936909950982681039022 4.431931003819940428911650087684 1.201688846852352776650718624296
H -1.259652211132231247603385781986 4.469197802384399231812039943179 2.451393615686668692177363482188
end
basis spherical
end
dft
iterations 200
xc b3lyp
direct
grid nodisk
end
driver
loose
maxiter 500
end
task dft optimize
|